Enkhuizen heeft verschillende havens. De schepen van NAUPAR hebben ligplaatsen aan de Gependam, de Oude Harlingersteiger en in de Buitenhaven. De Oude Harlingersteiger bevindt zich aan de buitenkant van de Wierdijk en wordt veel gebruikt voor bezoek aan het Zuiderzeemuseum. De Oude Harlingersteiger is goed bereikbaar, zowel via het openbaar vervoer als met de auto.